Помимо режима командного дерева, в Web-интерфейсе имеется режим редактирования конфигурации в текстовом окне. Для перехода в текстовый режим и обратно следут нажать кнопку (Блокнот) или (Дерево), соответственно. Это можно сделать как в корне конфигурационного дерева, так и в отдельной ветви.

В текстовом режиме можно просматривать конфигурацию как целое и править её вручную. Это особенно удобно для клонирования однотипных объектов методом Copy&Paste с минимальными изменениями. При редактировании необходимо внимательно следить за правильностью отступов : , поскольку они определяют вложенность узлов. Если её нарушить, то полученная конфигурация будет неработоспособной. При попытке вернуться в режим дерева все изменения будут утеряны.

Чтобы убедиться, что созданная конфигурация не содержит формальных ошибок, после ручного редактирования рекомендуется выполнить команду _validate (в Web-interface — кнопка , Вытаращенные глаза). Если конфигурация неправильная, будет выведено предупреждение.

При работе в nsgsh можно редактировать конфигурацию или её фрагмент в редакторе nano, который вызывается с помощью команд _fullscreen или _edit (обе команды являются синонимами). Также можно выгрузить конфигурацию на ПК командой _print, отредактировать её и загрузить обратно на устройство командой _get. Эти операции доступны и на корне дерева, и в отдельном узле.

Помимо ручного редактирования, в определённых случаях система автоматически вносит изменения в конфигурацию, а именно:

• Настройка одних узлов конфигурации может приводить к изменениям в других узлах: автоматическому созданию и удалению правил фильтрации, NAT, туннелей и т.п. Данные изменения не применяются автоматически, о них только выводится предупреждение. Пользователю необходимо проанализировать их и, если он с ними согласен, применить и сохранить их вручную.
• В отдельных исключительных случаях разработчикам бывает необходимо в новой версии ПО изменить структуру уже существующего командного дерева, например, переименовать некоторый параметр или перенести его на один узел выше или ниже. Как правило, при этом в новую версию встраивается соответствующий конвертер для совместимости с имеющимися конфигурациями. При загрузке устройства он считывает старую конфигурацию из энергонезависимой памяти, вносит в неё необходимые изменения "на лету" и исполняет уже отредактированную конфигурацию. Сохранённая конфигурация, однако, остаётся при этом без изменений, и процедура повторяется при каждой следующей загрузке устройства. Чтобы избежать этого, следует после обновления ПО сохранить конфигурацию, даже если сам пользователь не вносил в неё никаких изменений. В любом случае, такие ситуации оговариваются особо в файле _readme_1st и в другой документации, сопровождающей выпуск новой версии.