В NSG Linux 2.1 предусмотрена возможность позволяет создавать и хранить несколько альтернативных конфигураций, например, для разных случаев применения устройства или для поэтапной отладки сетевого решения. (Как хорошо известно каждому геймеру, пройдя очередной левел, надо обязательно засейвиться, чтобы потом не начинать сначала.) Помимо заводской (по умолчанию) и текущей конфигурации, пользователь может создавать неограниченное число конфигураций, экспортировать и импортировать их. Для каждой пользовательской конфигурации создаётся отдельный узел в ветви .system.configurations. По умолчанию, она содержит единственный узел CURRENT, который относится к текущей конфигурации устройства и существует всегда.

Помимо стандартных протоколов, дерево пользовательской конфигурации может храниться непосредственно в самом значение параметра url для данной конфигурации.